污染原因芝棒污染的根本原因是競爭性雜菌入侵感染，芝棒大范圍污染事件多發(fā)生在靈芝栽培老產(chǎn)區(qū)，其污染原因歸納起來主要有以下幾個方面：栽培品種抗逆性減弱抗逆性減弱是品種種性退化的一個表現(xiàn)，這是芝棒污染的內(nèi)因。菌種不合格主要表現(xiàn)為栽培種帶有雜菌；菌齡過長，菌種老化，萌發(fā)力差，吃料慢，菌絲弱，接種后封面時間長；高溫、變溫培養(yǎng)的菌種，菌絲纖細(xì)無力，擴展緩慢。栽培季節(jié)安排不當(dāng)一是芝棒制作及接種期安排過晚（如2月以后），如春季突遇高溫天氣，發(fā)菌棚內(nèi)溫度達(dá)到40弋以上,極易“燒菌”，菌絲生理活動受到限制并逐漸死亡，各種雜菌趁機感染。二是芝棒制作及接種期安排過早（如11月以前），接種期間氣溫高，雜菌活躍，菌棒易感染。芝場環(huán)境污染主要是上年度染雜菌袋和出過芝的老袋以及當(dāng)年污染的菌袋在房前、屋后、馬路邊、芝場旁邊晾曬，沒有及時清理銷毀，致使大量霉菌孢子在空氣中飛揚，造成環(huán)境污染。

采用高壓滅菌的，升火前應(yīng)打開放氣閥門，當(dāng)水蒸氣大量噴發(fā)時，關(guān)閉放氣閥，加大火力，當(dāng)壓力表盤為0.15帕次放氣時開始計時，在此氣壓下持續(xù)4個小時即可停火。當(dāng)壓力表降至0帕?xí)r，打開放氣閥排氣，把壓力鍋門打開自然降溫。采用常用滅菌的，在蒸籠底部一角放一支溫度計，升火后溫度至100°C時開始計時，維持12個小時后?；?，悶上一夜，然后打開蒸。當(dāng)料溫降至40°C時，移入接種袋或接種箱中，然后放入酒精、棉塞、包扎帶、氣霧消毒盒、火機、接種鉤、菌種，菌種用百菌清或5%水浸洗，同時有紅、綠、黃等色雜菌的菌種，每四筒料放一包菌種。一切就緒后封閉接種箱，點燃消毒盒20分鐘后可實現(xiàn)接種，接種時操作人員預(yù)先用75%酒精消毒雙手，然后小心伸入接種箱中，從尾部撕開種袋接種，種頭接近棉塞處的表皮種 棄之不用。地養(yǎng)室培養(yǎng)，此時培養(yǎng)室溫度保持24~30°C,12小時后種子開始萌發(fā)吃料，20天后當(dāng)菌絲長至筒料一半時，把接種端袋口稍稍打開通氣培養(yǎng)，菌絲長滿后，零星出現(xiàn)原基時，進入菌棚排場管理。